Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO40Q9UH90 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms