Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms