Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHPF2Q9P2E5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms