Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHRF1Q9P1Y6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms