Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNKQ9P0W0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNKQ9P0W0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms