Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAPAQ9P0L0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAPAQ9P0L0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms