Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms