Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD3Q9NX63 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms