Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms