Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCLQ9NW38 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms