Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PKDREJQ9NTG1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms