Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM7SF3Q9NS93 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM7SF3Q9NS93 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms