Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms