Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTORQ9NRC9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms