Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms