Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf50Q9HD87 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms