Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPJQ9HC77 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPJQ9HC77 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms