Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C10orf88Q9H8K7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C10orf88Q9H8K7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms