Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP3Q9H4L4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms