Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF39Q9H2S5 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms