Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms