Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF1Q9BZW5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms