Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP2-4Q9BYR9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms