Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTFDC1Q9BY42 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTFDC1Q9BY42 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms