Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HIRIP3Q9BW71 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIRIP3Q9BW71 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms