Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KATNB1Q9BVA0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KATNB1Q9BVA0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms