Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms