Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYGO2Q9BRQ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms