Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms