Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms