Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3AQ99856 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms