Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGRRF1Q99675 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGRRF1Q99675 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms