Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC22A12Q96S37 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A12Q96S37 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms