Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CICQ96RK0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms