Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF12Q96QT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms