Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP4Q96PP9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms