Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RDH12Q96NR8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms