Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCLT1Q96NL6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms