Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNDC3BQ96NL0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms