Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC138Q96M89 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms