Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms