Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM47Q96LD4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms