Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD1Q96JS3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms