Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4AQ96JQ5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms