Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF333Q96JL9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF333Q96JL9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms