Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BORCS6Q96GS4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms