Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms