Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL53Q96EL3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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