Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEURL3Q96EH8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms