Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFT1Q96AA3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFT1Q96AA3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFT1Q96AA3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RFT1Q96AA3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFT1Q96AA3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFT1Q96AA3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFT1Q96AA3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms